Este dispositivo actúa como el riñón del acuario marino. Se encarga de eliminar la proteína y otros desechos orgánicos del acuario de agua salada.El funcionamiento del skimmer es muy sencillo. Por medio de una bomba se insertan microscópicas burbujas de aire en el torrente del agua. Estas burbujas consiguen que la suciedad (restos orgánicos, lípidos, proteínas y oligoelementos) se adhiera a ellas y suban a la superficie del skimmer y queden recogidas en el vaso colector del skimmer para que no vuelvan al agua del acuario. Esto ocurre antes de que los desechos se descompongan y se conviertan en diferentes compuestos den nitrógeno, lo cual afectaría bastante a la calidad de agua.